| Chain sequence(s) |
A: LTCNTCSVSLIGICLNPATATCSTNTSVCTTGRASFTGVLGFLGFNSQGCTEGAQCNGTVSGSILGASYTVTQTCCSTNNCNPVTS
C: LTCNTCSVSLIGICLNPATATCSTNTSVCTTGRASFTGVLGFLGFNSQGCTEGAQCNGTVSGSILGASYTVTQTCCSTNNCNPVTS B: LTCNTCSVSLIGICLNPATATCSTNTSVCTTGRASFTGVLGFLGFNSQGCTEGAQCNGTVSGSILGASYTVTQTCCSTNNCNPVTS E: MGKRTQPSWVTVFLFYSGCLFLLTNAQMKIPPETVQKWANSLSEQLNSVAVKYSGSALLQKKLNDVEPVIQIEKLDGAKLAQEFSDEIEKMLGSKMKSVKRLADTVEDADLYHEFNASLEFDYFNSLLINTMDEEGNYIELGGEFPLEDNEHFNNLPVNTLMSDIQVPTNVYNKDPDILNGVYMSEALNDVFISNFQKDPTLTWQFFGSSTGFFRLYPGIKWTADPNGVVAFDCRNRNWYIQAATSPKDIIIVVDISGSMKGLKLTIAKHTINTILDTLGENDFVNIIAYTDYVQYVEPCFKGTLVQADLDNREHFKLLVEDLQVKREGKVKKAMNESFWVLNQATEKGQGSLCNQAIMLITDGAMEDFQSVFEEFNWPERKVRVFTYLIGRDMTFAENVKWIACNNKGYYTHINTLADVQENVMEYLHVLSRPMVIDHDHDIIWTEAYMDSVLFNSMAQSLLLMTTVAMPVFSKKKETMSHGILLGVVGTDIPLVEVMMLAPRYKLGAHGYAFLITNNGYILAHPNLRPLYKDGKKLKPKPNYNSVDLTEAEWEDSNDTLRTAMVKGETGTLELDVRTAVDKGKRSLLLKNKYFYTTIDETPFSFGMVLTQGHGQYVFHGNVSIEEGLHDLQQPDLTIANEWTYCETDIDPQHRKLTQLQAVVRYLTGKEPELECDEVLLQQVLFDAVVTAPLEAYWTALMMSDAGVEDHIETAFLGTRSGLMRITRYIGKEERKGKNFLTPVDKENLFTMDHHPIWYRLAAENKPGQFYYYVPVDDINKEKNMLIAVTAVTVTAQNRIALAGAIGLQMSLNLLERRFWATAKEADDTDCSNVDGLCPLSCESIDINCYLVDNNGFIVISKERSDVGKFFGEVDGSVMAQLLKSGLFKRETLYDYQAMCKNSHHHASAARPLLSPFYNLMAVVKWLFSNLIMFFLEFNISGLWHNGFLVDAKSGYHTTHKQKKVESMVPCNTEYPGFIYDTSIRETNSIIKCGRCQKMFVLQQVLNSNLVMLVVQADCDCSRQYSPITLTPREENAKDCG D: LTCNTCSVSLIGICLNPATATCSTNTSVCTTGRASFTGVLGFLGFNSQGCTEGAQCNGTVSGSILGASYTVTQTCCSTNNCNPVTS input PDB |
| Selected Chain(s) | A,B,C,D,E |
| Distance of aggregation | 10 Å |
| FoldX usage | Yes |
| pH calculations | Yes |
| alphaCutter usage | No |
| Dynamic mode | No |
| Automated mutations | No |
| Downloads | Download all the data |
| Simulation log |
[INFO] Logger: Verbosity set to: 2 - [INFO] (00:00:01)
[WARNING] runJob: Working directory already exists (possibly overwriting previous results -ow
to prevent this behavior) (00:00:01)
[INFO] runJob: Starting aggrescan3d job on: input.pdb with all chain(s) selected (00:00:01)
[INFO] runJob: Creating pdb object from: input.pdb (00:00:01)
[INFO] PDB-Info: The input structure is globular. Max score is recommended for pH analysis. (00:00:05)
[INFO] FoldX: Starting FoldX energy minimization (00:00:06)
[INFO] Analysis: Starting Aggrescan4D on folded.pdb (00:18:01)
[INFO] agg3D: Running pKa-ANI on
/STORAGE/DATA/lcbio/aggreskan/e7e65ec83a938e7/tmp/folded.pdb (00:18:01)
[INFO] Main: Simulation completed successfully. (00:28:06)
|
The table below lists A4D score for protein residues. Residues with A4D score > 0.0000 are marked by yellow rows.
| residue index | residue name | chain | Aggrescan4D score | mutation |
|---|---|---|---|---|
| 1 | L | A | -0.4147 | |
| 2 | T | A | -0.5673 | |
| 3 | C | A | 0.0000 | |
| 4 | N | A | -0.5748 | |
| 5 | T | A | 0.0000 | |
| 6 | C | A | 0.0000 | |
| 7 | S | A | 0.3993 | |
| 8 | V | A | 0.6613 | |
| 9 | S | A | 0.0000 | |
| 10 | L | A | 0.0000 | |
| 11 | I | A | 0.0000 | |
| 12 | G | A | 0.0000 | |
| 13 | I | A | 0.4861 | |
| 14 | C | A | 0.0000 | |
| 15 | L | A | 0.0000 | |
| 16 | N | A | -0.2451 | |
| 17 | P | A | -0.1774 | |
| 18 | A | A | -0.3540 | |
| 19 | T | A | -0.4034 | |
| 20 | A | A | -0.2477 | |
| 21 | T | A | -0.4625 | |
| 22 | C | A | 0.0000 | |
| 23 | S | A | -0.9882 | |
| 24 | T | A | -0.8974 | |
| 25 | N | A | -1.3056 | |
| 26 | T | A | -0.7937 | |
| 27 | S | A | 0.0000 | |
| 28 | V | A | 0.0000 | |
| 29 | C | A | 0.0000 | |
| 30 | T | A | 0.0000 | |
| 31 | T | A | 0.0000 | |
| 32 | G | A | 0.0000 | |
| 33 | R | A | -1.1886 | |
| 34 | A | A | 0.0000 | |
| 35 | S | A | -0.0165 | |
| 36 | F | A | 0.4397 | |
| 37 | T | A | 0.2518 | |
| 38 | G | A | 0.0312 | |
| 39 | V | A | 1.3118 | |
| 40 | L | A | 1.8686 | |
| 41 | G | A | 1.0074 | |
| 42 | F | A | 1.4795 | |
| 43 | L | A | 1.6546 | |
| 44 | G | A | 0.0000 | |
| 45 | F | A | 0.0000 | |
| 46 | N | A | -0.3227 | |
| 47 | S | A | -0.2541 | |
| 48 | Q | A | 0.0000 | |
| 49 | G | A | 0.0000 | |
| 50 | C | A | 0.0000 | |
| 51 | T | A | 0.0000 | |
| 52 | E | A | -0.6053 | |
| 53 | G | A | -0.6306 | |
| 54 | A | A | -0.8952 | |
| 55 | Q | A | -1.5039 | |
| 56 | C | A | 0.0000 | |
| 57 | N | A | -1.7325 | |
| 58 | G | A | -0.6467 | |
| 59 | T | A | -0.1161 | |
| 60 | V | A | 0.7148 | |
| 61 | S | A | -0.0489 | |
| 62 | G | A | -0.1800 | |
| 63 | S | A | 0.0888 | |
| 64 | I | A | 0.8998 | |
| 65 | L | A | 1.4554 | |
| 66 | G | A | 0.2609 | |
| 67 | A | A | 0.2382 | |
| 68 | S | A | -0.0986 | |
| 69 | Y | A | -0.0047 | |
| 70 | T | A | -0.2034 | |
| 71 | V | A | 0.0000 | |
| 72 | T | A | -0.6962 | |
| 73 | Q | A | 0.0000 | |
| 74 | T | A | -0.8108 | |
| 75 | C | A | -0.5277 | |
| 76 | C | A | -0.3020 | |
| 77 | S | A | -0.5247 | |
| 78 | T | A | -0.7422 | |
| 79 | N | A | -1.4992 | |
| 80 | N | A | -1.2482 | |
| 81 | C | A | -0.5619 | |
| 82 | N | A | 0.0000 | |
| 83 | P | A | -0.3095 | |
| 84 | V | A | -0.0528 | |
| 85 | T | A | -0.0412 | |
| 86 | S | A | -0.3246 | |
| 1 | L | B | -0.3892 | |
| 2 | T | B | -0.5369 | |
| 3 | C | B | 0.0000 | |
| 4 | N | B | -0.5871 | |
| 5 | T | B | -0.2976 | |
| 6 | C | B | 0.0000 | |
| 7 | S | B | -0.3329 | |
| 8 | V | B | -0.0470 | |
| 9 | S | B | 0.0559 | |
| 10 | L | B | 0.0000 | |
| 11 | I | B | 0.0000 | |
| 12 | G | B | 0.0000 | |
| 13 | I | B | 0.3975 | |
| 14 | C | B | 0.0000 | |
| 15 | L | B | 0.0000 | |
| 16 | N | B | -0.3520 | |
| 17 | P | B | -0.3545 | |
| 18 | A | B | -0.3053 | |
| 19 | T | B | -0.4652 | |
| 20 | A | B | -0.3062 | |
| 21 | T | B | -0.4528 | |
| 22 | C | B | 0.0000 | |
| 23 | S | B | -0.6199 | |
| 24 | T | B | 0.0000 | |
| 25 | N | B | -1.0559 | |
| 26 | T | B | -0.6154 | |
| 27 | S | B | 0.0000 | |
| 28 | V | B | 0.0000 | |
| 29 | C | B | 0.0000 | |
| 30 | T | B | 0.0000 | |
| 31 | T | B | 0.0000 | |
| 32 | G | B | 0.0000 | |
| 33 | R | B | -1.2777 | |
| 34 | A | B | 0.0000 | |
| 35 | S | B | -0.1771 | |
| 36 | F | B | 0.0000 | |
| 37 | T | B | 0.1411 | |
| 38 | G | B | 0.0762 | |
| 39 | V | B | 1.3773 | |
| 40 | L | B | 1.8995 | |
| 41 | G | B | 0.9617 | |
| 42 | F | B | 0.0000 | |
| 43 | L | B | 1.4759 | |
| 44 | G | B | 0.0000 | |
| 45 | F | B | 0.0000 | |
| 46 | N | B | 0.0000 | |
| 47 | S | B | -0.3649 | |
| 48 | Q | B | -0.4041 | |
| 49 | G | B | -0.4183 | |
| 50 | C | B | -0.4937 | |
| 51 | T | B | 0.0000 | |
| 52 | E | B | -0.7961 | |
| 53 | G | B | -0.8245 | |
| 54 | A | B | -0.8702 | |
| 55 | Q | B | -1.6804 | |
| 56 | C | B | -1.3075 | |
| 57 | N | B | -1.7506 | |
| 58 | G | B | -1.0997 | |
| 59 | T | B | -0.4743 | |
| 60 | V | B | 0.2782 | |
| 61 | S | B | -0.1352 | |
| 62 | G | B | 0.1618 | |
| 63 | S | B | 0.5083 | |
| 64 | I | B | 0.0000 | |
| 65 | L | B | 1.6175 | |
| 66 | G | B | 0.4160 | |
| 67 | A | B | 0.1440 | |
| 68 | S | B | -0.2171 | |
| 69 | Y | B | 0.0000 | |
| 70 | T | B | -0.3190 | |
| 71 | V | B | 0.0000 | |
| 72 | T | B | -0.7857 | |
| 73 | Q | B | 0.0000 | |
| 74 | T | B | -0.8692 | |
| 75 | C | B | -0.5451 | |
| 76 | C | B | -0.2770 | |
| 77 | S | B | -0.5176 | |
| 78 | T | B | -0.7289 | |
| 79 | N | B | -1.4672 | |
| 80 | N | B | -1.1877 | |
| 81 | C | B | -0.5532 | |
| 82 | N | B | 0.0000 | |
| 83 | P | B | -0.3267 | |
| 84 | V | B | -0.1003 | |
| 85 | T | B | -0.0587 | |
| 86 | S | B | -0.5856 | |
| 1 | L | C | -0.3164 | |
| 2 | T | C | -0.4928 | |
| 3 | C | C | 0.0000 | |
| 4 | N | C | -0.5006 | |
| 5 | T | C | -0.1811 | |
| 6 | C | C | 0.0000 | |
| 7 | S | C | -0.2467 | |
| 8 | V | C | 0.1072 | |
| 9 | S | C | 0.0000 | |
| 10 | L | C | 0.0000 | |
| 11 | I | C | 0.0000 | |
| 12 | G | C | 0.0000 | |
| 13 | I | C | 0.4591 | |
| 14 | C | C | 0.0000 | |
| 15 | L | C | 0.0000 | |
| 16 | N | C | -0.3135 | |
| 17 | P | C | -0.3246 | |
| 18 | A | C | -0.2455 | |
| 19 | T | C | -0.4360 | |
| 20 | A | C | -0.0683 | |
| 21 | T | C | -0.1705 | |
| 22 | C | C | -0.3093 | |
| 23 | S | C | -0.4228 | |
| 24 | T | C | -0.7279 | |
| 25 | N | C | -1.2830 | |
| 26 | T | C | -0.8130 | |
| 27 | S | C | 0.0000 | |
| 28 | V | C | 0.0000 | |
| 29 | C | C | 0.0000 | |
| 30 | T | C | 0.0000 | |
| 31 | T | C | 0.0000 | |
| 32 | G | C | 0.0000 | |
| 33 | R | C | -1.1318 | |
| 34 | A | C | 0.0000 | |
| 35 | S | C | 0.0592 | |
| 36 | F | C | 0.4665 | |
| 37 | T | C | 0.2847 | |
| 38 | G | C | 0.2010 | |
| 39 | V | C | 1.4062 | |
| 40 | L | C | 2.0209 | |
| 41 | G | C | 1.2131 | |
| 42 | F | C | 1.6863 | |
| 43 | L | C | 1.7811 | |
| 44 | G | C | 0.0000 | |
| 45 | F | C | 0.2856 | |
| 46 | N | C | -0.2272 | |
| 47 | S | C | -0.2992 | |
| 48 | Q | C | 0.0000 | |
| 49 | G | C | -0.0929 | |
| 50 | C | C | 0.0282 | |
| 51 | T | C | 0.0000 | |
| 52 | E | C | -0.9121 | |
| 53 | G | C | -0.8898 | |
| 54 | A | C | -0.9144 | |
| 55 | Q | C | -1.7475 | |
| 56 | C | C | 0.0000 | |
| 57 | N | C | -1.8261 | |
| 58 | G | C | -1.1525 | |
| 59 | T | C | -0.5157 | |
| 60 | V | C | 0.1918 | |
| 61 | S | C | -0.1435 | |
| 62 | G | C | 0.1064 | |
| 63 | S | C | 0.3395 | |
| 64 | I | C | 0.0000 | |
| 65 | L | C | 1.6169 | |
| 66 | G | C | 0.4141 | |
| 67 | A | C | 0.1455 | |
| 68 | S | C | -0.1692 | |
| 69 | Y | C | 0.0000 | |
| 70 | T | C | -0.2612 | |
| 71 | V | C | 0.0000 | |
| 72 | T | C | -0.8063 | |
| 73 | Q | C | 0.0000 | |
| 74 | T | C | -0.8790 | |
| 75 | C | C | -0.5647 | |
| 76 | C | C | -0.2913 | |
| 77 | S | C | -0.4978 | |
| 78 | T | C | -0.7331 | |
| 79 | N | C | -1.4660 | |
| 80 | N | C | -1.2133 | |
| 81 | C | C | -0.5593 | |
| 82 | N | C | 0.0000 | |
| 83 | P | C | -0.2706 | |
| 84 | V | C | -0.0033 | |
| 85 | T | C | -0.0230 | |
| 86 | S | C | -0.3046 | |
| 1 | L | D | -0.3969 | |
| 2 | T | D | -0.7527 | |
| 3 | C | D | 0.0000 | |
| 4 | N | D | -0.4844 | |
| 5 | T | D | -0.2469 | |
| 6 | C | D | 0.0000 | |
| 7 | S | D | -0.3339 | |
| 8 | V | D | 0.0000 | |
| 9 | S | D | 0.0000 | |
| 10 | L | D | 0.0000 | |
| 11 | I | D | 1.9102 | |
| 12 | G | D | 0.0000 | |
| 13 | I | D | 1.2669 | |
| 14 | C | D | 0.0000 | |
| 15 | L | D | 0.4034 | |
| 16 | N | D | -0.3048 | |
| 17 | P | D | -0.2194 | |
| 18 | A | D | -0.1320 | |
| 19 | T | D | -0.6349 | |
| 20 | A | D | -0.3943 | |
| 21 | T | D | -0.9294 | |
| 22 | C | D | 0.0000 | |
| 23 | S | D | -1.4123 | |
| 24 | T | D | -1.2791 | |
| 25 | N | D | -1.3846 | |
| 26 | T | D | -0.9246 | |
| 27 | S | D | 0.0000 | |
| 28 | V | D | 0.0000 | |
| 29 | C | D | 0.0000 | |
| 30 | T | D | 0.0000 | |
| 31 | T | D | 0.0000 | |
| 32 | G | D | 0.0000 | |
| 33 | R | D | -1.0027 | |
| 34 | A | D | 0.0000 | |
| 35 | S | D | 0.4048 | |
| 36 | F | D | 0.8686 | |
| 37 | T | D | 0.5532 | |
| 38 | G | D | 0.4550 | |
| 39 | V | D | 1.9211 | |
| 40 | L | D | 2.1652 | |
| 41 | G | D | 1.3827 | |
| 42 | F | D | 2.2392 | |
| 43 | L | D | 2.4849 | |
| 44 | G | D | 0.0000 | |
| 45 | F | D | 0.7417 | |
| 46 | N | D | 0.0000 | |
| 47 | S | D | -0.1706 | |
| 48 | Q | D | 0.0000 | |
| 49 | G | D | -0.1218 | |
| 50 | C | D | -0.0947 | |
| 51 | T | D | 0.0000 | |
| 52 | E | D | -1.1767 | |
| 53 | G | D | -1.0111 | |
| 54 | A | D | -0.9737 | |
| 55 | Q | D | -1.7499 | |
| 56 | C | D | -1.4145 | |
| 57 | N | D | -1.7859 | |
| 58 | G | D | -1.0941 | |
| 59 | T | D | -0.4332 | |
| 60 | V | D | 0.3330 | |
| 61 | S | D | -0.0728 | |
| 62 | G | D | 0.1941 | |
| 63 | S | D | 0.6276 | |
| 64 | I | D | 1.4003 | |
| 65 | L | D | 1.7590 | |
| 66 | G | D | 0.5396 | |
| 67 | A | D | 0.5107 | |
| 68 | S | D | -0.0297 | |
| 69 | Y | D | 0.0000 | |
| 70 | T | D | -0.2138 | |
| 71 | V | D | 0.0000 | |
| 72 | T | D | -0.7575 | |
| 73 | Q | D | -0.9961 | |
| 74 | T | D | -0.8897 | |
| 75 | C | D | -0.5976 | |
| 76 | C | D | -0.2753 | |
| 77 | S | D | -0.5083 | |
| 78 | T | D | -0.7362 | |
| 79 | N | D | -1.4621 | |
| 80 | N | D | -1.1634 | |
| 81 | C | D | -0.5421 | |
| 82 | N | D | 0.0000 | |
| 83 | P | D | -0.2558 | |
| 84 | V | D | 0.1334 | |
| 85 | T | D | 0.1984 | |
| 86 | S | D | -0.2830 | |
| 1 | M | E | 0.1328 | |
| 2 | G | E | -1.3010 | |
| 3 | K | E | -2.7262 | |
| 4 | R | E | -3.0361 | |
| 5 | T | E | -2.1925 | |
| 6 | Q | E | -1.9341 | |
| 7 | P | E | -0.5469 | |
| 8 | S | E | 0.6234 | |
| 9 | W | E | 2.2279 | |
| 10 | V | E | 3.2637 | |
| 11 | T | E | 3.0515 | |
| 12 | V | E | 3.7185 | |
| 13 | F | E | 4.5783 | |
| 14 | L | E | 4.2759 | |
| 15 | F | E | 4.2275 | |
| 16 | Y | E | 3.9537 | |
| 17 | S | E | 2.8488 | |
| 18 | G | E | 2.6966 | |
| 19 | C | E | 3.3871 | |
| 20 | L | E | 3.7872 | |
| 21 | F | E | 4.0644 | |
| 22 | L | E | 3.4912 | |
| 23 | L | E | 2.7912 | |
| 24 | T | E | 1.0344 | |
| 25 | N | E | -0.7668 | |
| 26 | A | E | -0.6188 | |
| 27 | Q | E | -1.3447 | |
| 28 | M | E | -1.2517 | |
| 29 | K | E | -1.0373 | |
| 30 | I | E | 0.0000 | |
| 31 | P | E | 0.0000 | |
| 32 | P | E | -1.9074 | |
| 33 | E | E | -2.3973 | |
| 34 | T | E | 0.0000 | |
| 35 | V | E | 0.0000 | |
| 36 | Q | E | -2.5515 | |
| 37 | K | E | -2.6339 | |
| 38 | W | E | 0.0000 | |
| 39 | A | E | 0.0000 | |
| 40 | N | E | -1.7786 | |
| 41 | S | E | -1.5447 | |
| 42 | L | E | 0.0000 | |
| 43 | S | E | 0.0000 | |
| 44 | E | E | -2.2470 | |
| 45 | Q | E | -1.4494 | |
| 46 | L | E | 0.0000 | |
| 47 | N | E | -1.0432 | |
| 48 | S | E | -0.9529 | |
| 49 | V | E | 0.0000 | |
| 50 | A | E | 0.0000 | |
| 51 | V | E | 0.0326 | |
| 52 | K | E | -0.6315 | |
| 53 | Y | E | -0.1456 | |
| 54 | S | E | 0.0000 | |
| 55 | G | E | 0.0000 | |
| 56 | S | E | 0.0000 | |
| 57 | A | E | -0.4466 | |
| 58 | L | E | -0.4264 | |
| 59 | L | E | 0.0000 | |
| 60 | Q | E | -1.6320 | |
| 61 | K | E | -2.6387 | |
| 62 | K | E | -2.0257 | |
| 63 | L | E | 0.0000 | |
| 64 | N | E | -2.5763 | |
| 65 | D | E | -2.6295 | |
| 66 | V | E | -1.0614 | |
| 67 | E | E | -1.1390 | |
| 68 | P | E | -0.2867 | |
| 69 | V | E | 0.8770 | |
| 70 | I | E | 0.0000 | |
| 71 | Q | E | -1.6877 | |
| 72 | I | E | 0.0000 | |
| 73 | E | E | -2.9408 | |
| 74 | K | E | -2.8264 | |
| 75 | L | E | -2.1766 | |
| 76 | D | E | -2.8404 | |
| 77 | G | E | 0.0000 | |
| 78 | A | E | -1.6368 | |
| 79 | K | E | -2.7733 | |
| 80 | L | E | -2.0751 | |
| 81 | A | E | 0.0000 | |
| 82 | Q | E | -2.4010 | |
| 83 | E | E | -3.0925 | |
| 84 | F | E | 0.0000 | |
| 85 | S | E | 0.0000 | |
| 86 | D | E | -3.6184 | |
| 87 | E | E | -2.8534 | |
| 88 | I | E | 0.0000 | |
| 89 | E | E | -3.3603 | |
| 90 | K | E | -2.9798 | |
| 91 | M | E | -1.4529 | |
| 92 | L | E | 0.0000 | |
| 93 | G | E | 0.0000 | |
| 94 | S | E | -1.5651 | |
| 95 | K | E | 0.0000 | |
| 96 | M | E | 0.0000 | |
| 97 | K | E | -2.2997 | |
| 98 | S | E | 0.0000 | |
| 99 | V | E | 0.0000 | |
| 100 | K | E | -2.5513 | |
| 101 | R | E | -2.2128 | |
| 102 | L | E | 0.0000 | |
| 103 | A | E | 0.0000 | |
| 104 | D | E | -2.5986 | |
| 105 | T | E | -1.6302 | |
| 106 | V | E | 0.0000 | |
| 107 | E | E | 0.0000 | |
| 108 | D | E | -1.1488 | |
| 109 | A | E | -0.3785 | |
| 110 | D | E | 0.0000 | |
| 111 | L | E | 0.0193 | |
| 112 | Y | E | 0.9425 | |
| 113 | H | E | 0.1920 | |
| 114 | E | E | -0.6758 | |
| 115 | F | E | 0.5678 | |
| 116 | N | E | -0.6620 | |
| 117 | A | E | -0.7010 | |
| 118 | S | E | -0.5937 | |
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| 120 | E | E | -2.1235 | |
| 121 | F | E | -1.5388 | |
| 122 | D | E | -2.2377 | |
| 123 | Y | E | 0.0000 | |
| 124 | F | E | -0.3667 | |
| 125 | N | E | 0.0000 | |
| 126 | S | E | 0.0000 | |
| 127 | L | E | 0.2023 | |
| 128 | L | E | 0.0797 | |
| 129 | I | E | 0.0000 | |
| 130 | N | E | -0.9251 | |
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| 132 | M | E | -1.1439 | |
| 133 | D | E | -2.5352 | |
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| 135 | E | E | -3.3235 | |
| 136 | G | E | -2.3291 | |
| 137 | N | E | -2.5288 | |
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| 139 | I | E | -1.5147 | |
| 140 | E | E | -1.9721 | |
| 141 | L | E | 0.0000 | |
| 142 | G | E | 0.0000 | |
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| 145 | F | E | 0.0000 | |
| 146 | P | E | -0.8549 | |
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| 158 | V | E | 0.0000 | |
| 159 | N | E | 0.0000 | |
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| 175 | D | E | -1.3381 | |
| 176 | P | E | -1.4026 | |
| 177 | D | E | -1.6753 | |
| 178 | I | E | 0.0000 | |
| 179 | L | E | 0.0000 | |
| 180 | N | E | 0.0000 | |
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| 183 | Y | E | 0.4085 | |
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| 195 | N | E | 0.0000 | |
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| 200 | P | E | -0.8870 | |
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| 251 | I | E | 0.0000 | |
| 252 | I | E | 0.0000 | |
| 253 | V | E | 0.0000 | |
| 254 | V | E | 0.0000 | |
| 255 | D | E | 0.0000 | |
| 256 | I | E | 0.0000 | |
| 257 | S | E | 0.0000 | |
| 258 | G | E | -2.0637 | |
| 259 | S | E | -1.5559 | |
| 260 | M | E | 0.0000 | |
| 261 | K | E | -2.1030 | |
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| 271 | T | E | 0.0000 | |
| 272 | I | E | 0.0000 | |
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| 275 | I | E | 0.0000 | |
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| 278 | T | E | 0.0000 | |
| 279 | L | E | 0.0000 | |
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| 294 | V | E | -0.5096 | |
| 295 | Q | E | -0.5653 | |
| 296 | Y | E | 0.0000 | |
| 297 | V | E | -0.1366 | |
| 298 | E | E | 0.0000 | |
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| 314 | E | E | -1.4450 | |
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| 331 | V | E | 0.0000 | |
| 332 | K | E | -2.5460 | |
| 333 | K | E | -2.4035 | |
| 334 | A | E | 0.0000 | |
| 335 | M | E | 0.0000 | |
| 336 | N | E | -1.5359 | |
| 337 | E | E | -1.0593 | |
| 338 | S | E | 0.0000 | |
| 339 | F | E | 0.0000 | |
| 340 | W | E | 0.0119 | |
| 341 | V | E | 0.0000 | |
| 342 | L | E | 0.0000 | |
| 343 | N | E | -1.6059 | |
| 344 | Q | E | -1.9913 | |
| 345 | A | E | 0.0000 | |
| 346 | T | E | -1.8623 | |
| 347 | E | E | -3.1836 | |
| 348 | K | E | -3.2374 | |
| 349 | G | E | -2.1737 | |
| 350 | Q | E | -2.0275 | |
| 351 | G | E | -0.4596 | |
| 352 | S | E | 0.3755 | |
| 353 | L | E | 0.9457 | |
| 354 | C | E | 0.8292 | |
| 355 | N | E | 0.0000 | |
| 356 | Q | E | 0.0000 | |
| 357 | A | E | 0.0000 | |
| 358 | I | E | 0.0000 | |
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| 360 | L | E | 0.0000 | |
| 361 | I | E | 0.0000 | |
| 362 | T | E | 0.0000 | |
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| 364 | G | E | -0.3996 | |
| 365 | A | E | 0.0000 | |
| 366 | M | E | 0.0737 | |
| 367 | E | E | -1.4977 | |
| 368 | D | E | -2.3071 | |
| 369 | F | E | 0.0000 | |
| 370 | Q | E | -1.9952 | |
| 371 | S | E | -1.8396 | |
| 372 | V | E | 0.0000 | |
| 373 | F | E | 0.0000 | |
| 374 | E | E | -2.6016 | |
| 375 | E | E | -2.4179 | |
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| 377 | N | E | 0.0000 | |
| 378 | W | E | -1.9961 | |
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| 381 | R | E | -2.7855 | |
| 382 | K | E | -2.5998 | |
| 383 | V | E | 0.0000 | |
| 384 | R | E | -1.2371 | |
| 385 | V | E | 0.0000 | |
| 386 | F | E | 0.0000 | |
| 387 | T | E | 0.0000 | |
| 388 | Y | E | 0.0000 | |
| 389 | L | E | 0.0000 | |
| 390 | I | E | 0.0000 | |
| 391 | G | E | 0.0000 | |
| 392 | R | E | -2.7850 | |
| 393 | D | E | -2.3519 | |
| 394 | M | E | -0.7940 | |
| 395 | T | E | -0.4243 | |
| 396 | F | E | -0.0785 | |
| 397 | A | E | 0.0000 | |
| 398 | E | E | -1.9677 | |
| 399 | N | E | -1.5235 | |
| 400 | V | E | 0.0000 | |
| 401 | K | E | -1.5446 | |
| 402 | W | E | -0.7115 | |
| 403 | I | E | 0.0000 | |
| 404 | A | E | 0.0000 | |
| 405 | C | E | -0.0293 | |
| 406 | N | E | -0.5870 | |
| 407 | N | E | 0.0000 | |
| 408 | K | E | -1.8640 | |
| 409 | G | E | -0.6194 | |
| 410 | Y | E | 0.1516 | |
| 411 | Y | E | -0.0695 | |
| 412 | T | E | 0.0000 | |
| 413 | H | E | -0.9208 | |
| 414 | I | E | 0.0000 | |
| 415 | N | E | -1.2059 | |
| 416 | T | E | -0.2508 | |
| 417 | L | E | 0.2211 | |
| 418 | A | E | -0.4342 | |
| 419 | D | E | -1.0910 | |
| 420 | V | E | 0.0000 | |
| 421 | Q | E | -1.5940 | |
| 422 | E | E | -2.3882 | |
| 423 | N | E | -1.4603 | |
| 424 | V | E | 0.0000 | |
| 425 | M | E | 0.0000 | |
| 426 | E | E | -0.9874 | |
| 427 | Y | E | 0.0000 | |
| 428 | L | E | 0.0000 | |
| 429 | H | E | -0.6907 | |
| 430 | V | E | -0.6540 | |
| 431 | L | E | 0.0000 | |
| 432 | S | E | 0.0000 | |
| 433 | R | E | -1.1211 | |
| 434 | P | E | -0.9000 | |
| 435 | M | E | -1.4806 | |
| 436 | V | E | 0.0000 | |
| 437 | I | E | -0.3948 | |
| 438 | D | E | -2.1339 | |
| 439 | H | E | -2.1781 | |
| 440 | D | E | -3.0363 | |
| 441 | H | E | -2.5123 | |
| 442 | D | E | -2.3823 | |
| 443 | I | E | -1.1646 | |
| 444 | I | E | -0.2249 | |
| 445 | W | E | 0.0000 | |
| 446 | T | E | 0.0000 | |
| 447 | E | E | -0.3025 | |
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| 450 | M | E | 0.0000 | |
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| 455 | F | E | 0.0000 | |
| 456 | N | E | -0.9958 | |
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| 459 | A | E | 0.1438 | |
| 460 | Q | E | 0.0000 | |
| 461 | S | E | 0.2349 | |
| 462 | L | E | 0.6293 | |
| 463 | L | E | 0.6902 | |
| 464 | L | E | 0.5307 | |
| 465 | M | E | 0.0000 | |
| 466 | T | E | 0.0000 | |
| 467 | T | E | 0.0000 | |
| 468 | V | E | 0.0000 | |
| 469 | A | E | 0.0000 | |
| 470 | M | E | 0.0000 | |
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| 474 | S | E | 0.0000 | |
| 475 | K | E | -1.4887 | |
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| 478 | E | E | -2.9960 | |
| 479 | T | E | -1.6088 | |
| 480 | M | E | -1.3670 | |
| 481 | S | E | -1.2146 | |
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| 483 | G | E | 0.0000 | |
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| 486 | L | E | 0.3175 | |
| 487 | G | E | 0.0000 | |
| 488 | V | E | 0.0000 | |
| 489 | V | E | 0.0000 | |
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| 500 | M | E | 0.2342 | |
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| 537 | K | E | -3.0845 | |
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| 542 | P | E | -0.3445 | |
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| 545 | N | E | 0.0000 | |
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| 557 | S | E | -1.2110 | |
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| 563 | T | E | -1.5911 | |
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| 565 | M | E | 0.0000 | |
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| 569 | E | E | -2.5154 | |
| 570 | T | E | -1.3337 | |
| 571 | G | E | -0.5890 | |
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| 574 | E | E | -2.4730 | |
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| 585 | K | E | -1.0949 | |
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| 619 | F | E | 0.0000 | |
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| 624 | S | E | -1.0136 | |
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| 627 | E | E | -2.6959 | |
| 628 | G | E | 0.0000 | |
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| 630 | H | E | -2.4025 | |
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| 635 | P | E | -0.7907 | |
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| 639 | I | E | 0.0000 | |
| 640 | A | E | 0.0000 | |
| 641 | N | E | -1.9101 | |
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| 643 | W | E | 0.0000 | |
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| 646 | C | E | 0.0000 | |
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| 652 | P | E | -1.6949 | |
| 653 | Q | E | -1.9061 | |
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| 659 | Q | E | 0.0000 | |
| 660 | L | E | -0.5191 | |
| 661 | Q | E | -1.0678 | |
| 662 | A | E | 0.0000 | |
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| 664 | V | E | -0.8546 | |
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| 670 | K | E | -2.4980 | |
| 671 | E | E | -2.2104 | |
| 672 | P | E | -2.1720 | |
| 673 | E | E | -2.8341 | |
| 674 | L | E | 0.0000 | |
| 675 | E | E | -2.7035 | |
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| 678 | E | E | -2.0596 | |
| 679 | V | E | -0.4500 | |
| 680 | L | E | 0.0000 | |
| 681 | L | E | 0.0000 | |
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| 683 | Q | E | 0.0000 | |
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| 734 | E | E | -3.6591 | |
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| 780 | N | E | 0.0000 | |
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| 784 | N | E | -1.6692 | |
| 785 | M | E | 0.0000 | |
| 786 | L | E | 0.0000 | |
| 787 | I | E | 0.0000 | |
| 788 | A | E | 0.0000 | |
| 789 | V | E | 0.0000 | |
| 790 | T | E | 0.0000 | |
| 791 | A | E | 0.0000 | |
| 792 | V | E | 0.0000 | |
| 793 | T | E | 0.0000 | |
| 794 | V | E | 0.0000 | |
| 795 | T | E | -0.7035 | |
| 796 | A | E | -1.3346 | |
| 797 | Q | E | -2.2751 | |
| 798 | N | E | -1.8984 | |
| 799 | R | E | -1.6076 | |
| 800 | I | E | 0.3041 | |
| 801 | A | E | 0.0000 | |
| 802 | L | E | 0.0000 | |
| 803 | A | E | 0.0000 | |
| 804 | G | E | 0.0000 | |
| 805 | A | E | 0.0000 | |
| 806 | I | E | 0.0000 | |
| 807 | G | E | 0.0000 | |
| 808 | L | E | 0.0000 | |
| 809 | Q | E | 0.0000 | |
| 810 | M | E | 0.0000 | |
| 811 | S | E | 0.0000 | |
| 812 | L | E | 0.0000 | |
| 813 | N | E | -1.3371 | |
| 814 | L | E | 0.0000 | |
| 815 | L | E | 0.0000 | |
| 816 | E | E | -1.5178 | |
| 817 | R | E | -2.1208 | |
| 818 | R | E | -1.3219 | |
| 819 | F | E | 0.0000 | |
| 820 | W | E | -1.2266 | |
| 821 | A | E | -1.0057 | |
| 822 | T | E | -0.9880 | |
| 823 | A | E | 0.0000 | |
| 824 | K | E | -1.6840 | |
| 825 | E | E | -1.6081 | |
| 826 | A | E | -1.9910 | |
| 827 | D | E | -3.0501 | |
| 828 | D | E | -3.1020 | |
| 829 | T | E | -2.2456 | |
| 830 | D | E | -2.6124 | |
| 831 | C | E | -1.6467 | |
| 832 | S | E | -1.3525 | |
| 833 | N | E | -1.8202 | |
| 834 | V | E | -1.4450 | |
| 835 | D | E | -1.9590 | |
| 836 | G | E | -1.2295 | |
| 837 | L | E | -0.2988 | |
| 838 | C | E | -0.9097 | |
| 839 | P | E | -1.1690 | |
| 840 | L | E | 0.0000 | |
| 841 | S | E | -1.1602 | |
| 842 | C | E | 0.0000 | |
| 843 | E | E | -1.8177 | |
| 844 | S | E | -0.3696 | |
| 845 | I | E | 0.9105 | |
| 846 | D | E | -0.4068 | |
| 847 | I | E | 0.0000 | |
| 848 | N | E | -0.9346 | |
| 849 | C | E | 0.0000 | |
| 850 | Y | E | 0.0000 | |
| 851 | L | E | 0.0000 | |
| 852 | V | E | 0.0000 | |
| 853 | D | E | 0.0000 | |
| 854 | N | E | -0.1580 | |
| 855 | N | E | 0.0000 | |
| 856 | G | E | 0.0000 | |
| 857 | F | E | 0.0000 | |
| 858 | I | E | 0.0000 | |
| 859 | V | E | 0.0000 | |
| 860 | I | E | 0.0000 | |
| 861 | S | E | 0.0000 | |
| 862 | K | E | -2.5308 | |
| 863 | E | E | -3.1039 | |
| 864 | R | E | -2.8660 | |
| 865 | S | E | -2.0934 | |
| 866 | D | E | -1.7039 | |
| 867 | V | E | 0.0000 | |
| 868 | G | E | -0.8926 | |
| 869 | K | E | -0.8043 | |
| 870 | F | E | 0.0000 | |
| 871 | F | E | 0.0000 | |
| 872 | G | E | 0.0000 | |
| 873 | E | E | -0.5877 | |
| 874 | V | E | 0.0004 | |
| 875 | D | E | -0.3198 | |
| 876 | G | E | 0.0000 | |
| 877 | S | E | 0.0000 | |
| 878 | V | E | 0.0000 | |
| 879 | M | E | 0.0000 | |
| 880 | A | E | -0.4646 | |
| 881 | Q | E | -0.8570 | |
| 882 | L | E | 0.0000 | |
| 883 | L | E | -1.2916 | |
| 884 | K | E | -1.9030 | |
| 885 | S | E | -1.1076 | |
| 886 | G | E | -1.2898 | |
| 887 | L | E | 0.0000 | |
| 888 | F | E | 0.0000 | |
| 889 | K | E | -2.0787 | |
| 890 | R | E | -2.2554 | |
| 891 | E | E | -1.3232 | |
| 892 | T | E | -0.7874 | |
| 893 | L | E | 0.0000 | |
| 894 | Y | E | -0.5796 | |
| 895 | D | E | -0.6601 | |
| 896 | Y | E | -0.3009 | |
| 897 | Q | E | 0.0000 | |
| 898 | A | E | -0.2947 | |
| 899 | M | E | -0.4078 | |
| 900 | C | E | -1.3570 | |
| 901 | K | E | -1.9714 | |
| 902 | N | E | -1.8218 | |
| 903 | S | E | -1.8132 | |
| 904 | H | E | -2.1358 | |
| 905 | H | E | -1.9043 | |
| 906 | H | E | -2.2227 | |
| 907 | A | E | -0.9801 | |
| 908 | S | E | -0.7189 | |
| 909 | A | E | -0.1821 | |
| 910 | A | E | -0.3817 | |
| 911 | R | E | -0.4188 | |
| 912 | P | E | -0.0405 | |
| 913 | L | E | 0.7544 | |
| 914 | L | E | 1.6177 | |
| 915 | S | E | 1.0698 | |
| 916 | P | E | 0.8450 | |
| 917 | F | E | 2.4214 | |
| 918 | Y | E | 1.5948 | |
| 919 | N | E | 0.0000 | |
| 920 | L | E | 0.0000 | |
| 921 | M | E | 0.9376 | |
| 922 | A | E | 0.5351 | |
| 923 | V | E | 0.0000 | |
| 924 | V | E | 0.0000 | |
| 925 | K | E | 0.0000 | |
| 926 | W | E | 0.3440 | |
| 927 | L | E | 0.0000 | |
| 928 | F | E | 0.9127 | |
| 929 | S | E | 0.6245 | |
| 930 | N | E | 0.0000 | |
| 931 | L | E | 0.9924 | |
| 932 | I | E | 0.0000 | |
| 933 | M | E | 1.0747 | |
| 934 | F | E | 1.1838 | |
| 935 | F | E | 1.6490 | |
| 936 | L | E | 0.0000 | |
| 937 | E | E | 0.0000 | |
| 938 | F | E | 1.0608 | |
| 939 | N | E | 0.0000 | |
| 940 | I | E | 0.9185 | |
| 941 | S | E | 0.4996 | |
| 942 | G | E | 0.0974 | |
| 943 | L | E | 0.2461 | |
| 944 | W | E | 0.1299 | |
| 945 | H | E | -0.3671 | |
| 946 | N | E | 0.0000 | |
| 947 | G | E | -0.1359 | |
| 948 | F | E | 0.7827 | |
| 949 | L | E | 0.7245 | |
| 950 | V | E | -0.1888 | |
| 951 | D | E | -1.9393 | |
| 952 | A | E | -1.6056 | |
| 953 | K | E | -2.2378 | |
| 954 | S | E | -1.1748 | |
| 955 | G | E | -0.6291 | |
| 956 | Y | E | 0.1939 | |
| 957 | H | E | -0.8127 | |
| 958 | T | E | -0.8612 | |
| 959 | T | E | -1.3970 | |
| 960 | H | E | -2.6690 | |
| 961 | K | E | -3.7153 | |
| 962 | Q | E | -3.3983 | |
| 963 | K | E | -3.4455 | |
| 964 | K | E | -2.7779 | |
| 965 | V | E | -0.8530 | |
| 966 | E | E | -2.0051 | |
| 967 | S | E | -1.1109 | |
| 968 | M | E | -0.7430 | |
| 969 | V | E | -0.1071 | |
| 970 | P | E | -0.0469 | |
| 971 | C | E | -0.9928 | |
| 972 | N | E | -1.6049 | |
| 973 | T | E | 0.0000 | |
| 974 | E | E | -1.6645 | |
| 975 | Y | E | -1.1899 | |
| 976 | P | E | -0.8870 | |
| 977 | G | E | 0.0000 | |
| 978 | F | E | 0.0000 | |
| 979 | I | E | -0.4737 | |
| 980 | Y | E | 0.0000 | |
| 981 | D | E | -0.8280 | |
| 982 | T | E | -0.7209 | |
| 983 | S | E | -0.7878 | |
| 984 | I | E | -1.1080 | |
| 985 | R | E | -2.4599 | |
| 986 | E | E | -2.7255 | |
| 987 | T | E | -1.7207 | |
| 988 | N | E | -1.5471 | |
| 989 | S | E | -0.7372 | |
| 990 | I | E | -0.6339 | |
| 991 | I | E | 0.0000 | |
| 992 | K | E | -2.4765 | |
| 993 | C | E | 0.0000 | |
| 994 | G | E | -2.5782 | |
| 995 | R | E | -2.6726 | |
| 996 | C | E | -2.5719 | |
| 997 | Q | E | -2.4951 | |
| 998 | K | E | 0.0000 | |
| 999 | M | E | 0.0000 | |
| 1000 | F | E | 0.0000 | |
| 1001 | V | E | 0.0000 | |
| 1002 | L | E | 0.0000 | |
| 1003 | Q | E | 0.0000 | |
| 1004 | Q | E | 0.0000 | |
| 1005 | V | E | 0.0000 | |
| 1006 | L | E | -0.5833 | |
| 1007 | N | E | -1.1319 | |
| 1008 | S | E | -0.5770 | |
| 1009 | N | E | 0.0000 | |
| 1010 | L | E | 0.0000 | |
| 1011 | V | E | 0.0000 | |
| 1012 | M | E | 0.0000 | |
| 1013 | L | E | 0.0000 | |
| 1014 | V | E | 0.0000 | |
| 1015 | V | E | 0.0000 | |
| 1016 | Q | E | 0.0000 | |
| 1017 | A | E | -1.0218 | |
| 1018 | D | E | -2.1554 | |
| 1019 | C | E | 0.0000 | |
| 1020 | D | E | -3.0761 | |
| 1021 | C | E | 0.0000 | |
| 1022 | S | E | -1.9236 | |
| 1023 | R | E | -2.8810 | |
| 1024 | Q | E | -2.6160 | |
| 1025 | Y | E | -1.2372 | |
| 1026 | S | E | -0.9004 | |
| 1027 | P | E | -0.6048 | |
| 1028 | I | E | 0.0739 | |
| 1029 | T | E | -0.0978 | |
| 1030 | L | E | -0.3433 | |
| 1031 | T | E | -0.7037 | |
| 1032 | P | E | -1.7377 | |
| 1033 | R | E | -3.2807 | |
| 1034 | E | E | -3.5835 | |
| 1035 | E | E | -3.1471 | |
| 1036 | N | E | -3.1858 | |
| 1037 | A | E | -2.5484 | |
| 1038 | K | E | -3.1027 | |
| 1039 | D | E | -2.7861 | |
| 1040 | C | E | -1.2445 | |
| 1041 | G | E | -1.3132 |
Calculations for various pH values
This page contains details and comparisons for all models calculated at different pH points.
Please find suggestions on interpreting the results below. More details can be found in the Tutorial.
The input structure is globular. Max score is recommended for pH analysis.
pH |
Average A4D Score |
Max A4D Score |
|||
| 4.0 | -0.3221 | 7.8715 | View | CSV | PDB |
| 4.5 | -0.3768 | 7.8715 | View | CSV | PDB |
| 5.0 | -0.4431 | 7.8715 | View | CSV | PDB |
| 5.5 | -0.509 | 7.8715 | View | CSV | PDB |
| 6.0 | -0.5621 | 7.8715 | View | CSV | PDB |
| 6.5 | -0.5934 | 7.8715 | View | CSV | PDB |
| 7.0 | -0.6027 | 7.8715 | View | CSV | PDB |
| 7.5 | -0.5975 | 7.8714 | View | CSV | PDB |
| 8.0 | -0.5837 | 7.8713 | View | CSV | PDB |
| 8.5 | -0.563 | 7.871 | View | CSV | PDB |
| 9.0 | -0.5347 | 7.8699 | View | CSV | PDB |
ALA alanine
ARG arginine
ASN asparagine
ASP aspartic acid
CYS cysteine
GLN glutamine
GLU glutamic acid
GLY glycine
HIS histidine
ILE isoleucine
LEU leucine
LYS lysine
MET methionine
PHE phenylalanine
PRO proline
SER serine
THR threonine
TRP tryptophan
TYR tyrosine
VAL valine